Massagué es uno de los investigadores más importantes en el área de la metástasis del cáncer, autor de unos 250 artículos científicos sobre estos temas y uno de los cincuenta investigadores más citados en todas las áreas científicas en los últimos veinte años.Cuenta, entre otros galardones, con el Príncipe de Asturias de Investigación Científica y Técnica de 2004. Este galardón internacional está dotado con 400.000 euros.
Esta es la primera edición de los Premios Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento, uno de los galardones que, por su dotación económica, 3,2 millones de euros anuales, y la amplitud de las disciplinas científicas y artísticas abarcadas, pueden considerarse los más importantes del mundo, tras los Nobel.