Una nueva entrega que, tras el éxito de hace tres años de Zipi y Zape y el club de la canica, su director afrontó como si fuera "una película nueva". "Desde el principio tenía claro que no quería hacer una película que fuera la clásica secuela. Hay una nueva aventura, un nuevo villano, nuevos amigos... un nuevo desafío", afirma en este Making of en exclusiva de la película.
Precisamente una de las grandes novedades es Elena Anaya, el gran fichaje de Zipi y Zape y La Isla del Capitán en la que encarna a la pérfida Señorita Pam. La ganadora del Goya a la mejor actriz por La piel que habito también destaca que una de las claves de esta nueva aventura son sus virtudes técnicas, su genial ambientación y decorados. "Cuando llegas al set cada día es como entrar en un sueño de verdad", asegura.
Llegan las navidades y Zipi y Zape la vuelven a liar parda. Esta vez la travesura es tan grande que son castigados sin vacaciones y obligados a acompañar a sus padres a lo que parece ser un aburrido viaje en barco. Para su sorpresa, el destino es una espectacular y remota isla.
Allí, una terrible tormenta les obliga a refugiarse en la mansión de la excéntrica señorita Pam, donde niños sin familia disfrutan de un paraíso sin reglas. Ayudados por sus nuevos amigos, Flequi, Maqui y Pipi, los hermanos descubren que la repentina desaparición de sus padres en mitad de la noche guarda relación con el secreto que encierran la misteriosa isla y sus extraños habitantes.