El Gobierno de Juan José Ibarretxe ha advertido a los terroristas de que "no va a conseguir paralizar" a la sociedad vasca. A través de un comunicado, el Gobierno de Euskadi ha cuestionado "qué tipo de sociedad pretenden construir quienes defienden sus ideas a bombazo limpio". La presidenta de las Juntas Generales de Guipúzcoa, Rafaela Romero, ha criticado el empeño de los terroristas por destruir y atentar contra todo lo que se les pone delante" pero subrayó que "los demócratas estaremos ahí, firmes, para demostrar que son una minoría ". Asimismo, Romero, ha mostrado su solidaridad con las tres personas que han resultado heridas leves en el atentado.
El PSE-EE de Guipúzcoa ha rechazado esta evidente prueba de "impotencia y frustración" de los "radicales abertzales". Así lo ha calificado el secretario general de este grupo, Iñaki Arriola. Además de mandar un mensaje de apoyo a los heridos, el dirigente socialista ha subrayado que "la 'Y vasca' se va a construir", al tiempo que pedía a las las instituciones vascas expresen su apoyo "nítido" a esta "vital e importante infraestructura de enorme trascendencia para el desarrollo y futuro de Euskadi".
La presidenta de los populares guipúzcoanos, María José Usandizaga, por su parte, ha reiterado "la única manera de acabar con el terrorismo es luchar contra él con los medios policiales y judiciales de que dispone el Estado de Derecho". Usandiaga, ha deseado una pronta recuperación a los heridos por ETA en Zarautz, que con este ataque "vuelve a demostrar y a dejar patente que ETA no va a desaparecer por mucho que se lo pidan algunos".
La Confederación Empresarial Vasca (Confebask)ha lamentado en una nota la "intolerabel violencia" con la que "unos pocos" tratan de oponerse a los mayoritarios deseos de paz y progreso de los ciudadanos vascos". Asimismo, han destacado "la gran contribución que tanto Amenazar, una empresa especialmente comprometida con el país".ZA