El objetivo del IMI-ENS es mejorar la salud y los servicios sanitarios de los ciudadanos a través de la generación y difusión del conocimiento, realizando actividades de investigación y docencia en las diferentes áreas de conocimiento de la Salud Pública.
Para ello, el nuevo órgano organizará y desarrollará programas oficiales de postgrado y de formación continuada, así como la prestación de asesoría en salud pública, administración sanitaria e investigación biomédica al Sistema Nacional de Salud, a organismos internacionales y a otras instituciones del sistema español de ciencia y tecnología.
Forman parte del Consejo Rector por parte del ISCIII, el director de la entidad, Antonio L. Andreu; el subdirector general de Investigación en Terapia Celular y Medicina Regenerativa, Javier Arias; el director de Relaciones Institucionales, Jesús Fernández Crespo; y el director de la ENS, Cristóbal Belda.
Por parte de la UNED los miembros son el rector, Alejandro Tiana Ferrer; el rector honorífico, Juan Antonio Gimeno Ullastres; el vicerrector de Investigación, Ricardo Mairal Usón; y la vicerrectora de Formación Permanente, María García Alonso.
En esta primera etapa la presidencia la ocupará L. Andreu; la vicepresidencia la ostentará Alejandro Tiana y el secretario será Belda, quien, a su vez, ocupará el cargo de dirección, mientras que el subdirector será Gimeno Ullastres.