La propuesta vasca se basaba en que sólo una pequeña parte de aguas que, son subterráneas, en la cabecera del río se sitúan en territorio de Burgos, en Castilla y León, lo que a su juicio no justifica que la gestión de toda la cuenca sea de la Confederación Cantábrica.
Pero tanto PP como PSOE han defendido que el Nervión tiene un afluente burgalés, el río Cadagua, y que es correcto por tanto que la gestión no sea de ninguna comunidad autónoma, sino estatal. UPyD ha añadido que también las aguas subterráneas son responsabilidad de la administración central.