El mandatario ha hecho este anuncio después de mantener una reunión con el Consejo Supremo de las Fuerzas Armadas (SCAF), según ha recogido el diario 'Al Ahram'.
Al Sisi ha afirmado anteriormente que el país se enfrenta a una batalla "difícil, dura, malvada" que "llevará mucho tiempo" en un discurso en la televisión estatal.
Al mando de esta nueva unidad estará Osama Roshdy, que ha sido ascendido a teniente general y se encargará de las amenazas terroristas en varias partes de Egipto, que incluyen la península del Sinaí.
Pese a que las autoridades no han hecho pública una cifra oficial de los muertos en la cadena de atentados, los medios indican que al menos 30 personas murieron. Los ataques fueron reivindicados por la rama egipcia del Estado Islámico, Ansar Bait al Maqdis.